AFFILIAZIONE
asst spedali civili di brescia
AUTORE PRINCIPALE
Ing. Duri Claudia
GRUPPO DI LAVORO
Ing. Viganò Gian Luca asst spedali civili di brescia
Ing. Capuzzo Martina asst spedali civili di brescia
Ing. Cicellini Gian Luca asst spedali civili di brescia
Ing. Goldoni Davide università degli studi di brescia
Ing. Ignoti Lucia Maria asst spedali civili di brescia
Dr.ssa Ing Albini Giulia asst spedali civili di brescia
Dr. Ing Morandi Luca asst spedali civili di brescia
Dr.ssa Ing Scarpellini Martina asst spedali civili di brescia
Dr. Ing. Pagnoncelli Diego politecnico di milano
AREA TEMATICA
ABSTRACT
Con l’obiettivo principale di istituire un punto di raccolta delle richieste di sequenziamento massivo al servizio dei laboratori specialistici presente presso l’ASST degli Spedali Civili di Brescia, è stata creata la NGS facility. Tale struttura, garantisce l’efficientamento del processo che, quando disperso sulle differenti realtà laboratoristiche, genera spreco di risorse.
Il nuovo modello organizzativo prevede l’accentramento fisico delle strumentazioni dell’ASST in un ambiente unico e con personale dedicato. L’organizzazione della diagnostica basata su tecnologia NGS si può così riassumere: il materiale biologico da sottoporre ad indagine viene accettato presso i laboratori di competenza (Anatomia Patologica, Laboratorio Ultraspecialistico, Microbiologia, Genetica medica) e in quelle sedi viene estratto il DNA dai campioni.
I campioni di DNA, pseudonimizzati, vengono inseriti nella lista di lavoro dell’NGS facility evidenziando il protocollo da applicare. I vari file prodotti durante le fasi precedenti vengono resi disponibili al laboratorio richiedente che potrà effettuare infine l’analisi terziaria.
Al fine di acquisire un sistema unico di gestione dei flussi di lavoro per i laboratori di genetica e piattaforme centralizzate specializzate di sequenziamento NGS con sistema hub-spoke, è stato effettuato un lavoro multidisciplinare tra Ingegneria Clinica, SIA e responsabile clinico della NGS facility. L’Ingegneria clinica ha effettuato il censimento delle apparecchiature coinvolte e dei loro software di concerto con il personale clinico e si è poi interfacciata con il SIA per studiare una soluzione che potesse essere compatibile con gli applicativi aziendali.
Il risultato è stata l’indizione e aggiudicazione di una gara che permetta l’implementazione di una soluzione compatibile da un lato con le apparecchiature e i verticali in uso, dall’altro con le richieste legate alla cybersecurity e di AGID (es. Il concetto di cloud first) a oggi in vigore.
