{"id":14053,"date":"2025-05-22T10:33:16","date_gmt":"2025-05-22T08:33:16","guid":{"rendered":"https:\/\/www.convegnonazionaleaiic.it\/ngs-facility-lesperienza-dellasst-spedali-civili-di-brescia\/"},"modified":"2025-06-04T14:25:34","modified_gmt":"2025-06-04T12:25:34","slug":"ngs-facility-lesperienza-dellasst-spedali-civili-di-brescia","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.convegnonazionaleaiic.it\/ngs-facility-lesperienza-dellasst-spedali-civili-di-brescia\/","title":{"rendered":"NGS FACILITY, L\u2019ESPERIENZA DELL\u2019ASST SPEDALI CIVILI DI BRESCIA"},"content":{"rendered":"<div class=\"row rigaaiic\">\n<div class=\"col-md-4 colaiic-4\">\n<p><img decoding=\"async\" class=\"imgaiic-1\" src=\"https:\/\/sem2000.s3.eu-west-1.amazonaws.com\/OLC\/0989478442373166690049893\/scent\/130500___4FroOYYN.jpg\" alt=\"\" \/><img decoding=\"async\" class=\"imgaiic-2\" src=\"https:\/\/sem2000.s3.eu-west-1.amazonaws.com\/OLC\/0989478442373166690049893\/scent\/130500_logoAff__Zf5QtCFe.jpg\" alt=\"\" \/><\/p>\n<p><strong><span class=\"titaffaiic-1\">AFFILIAZIONE<\/span><\/strong><\/p>\n<p class=\"affaiic-1\">asst spedali civili di brescia<\/p>\n<p><strong><br \/>\n<span class=\"titautaiic\">AUTORE PRINCIPALE<\/span><\/strong><\/p>\n<p class=\"autaiic\">Ing. Duri Claudia<\/p>\n<p><strong><span class=\"titrating\">VALUTA IL CHALLENGE<br \/>\n<\/span><\/strong><\/p>\n<div class=\"regaiic\"><em>Registrazione obbligatoria. Una valutazione consentita<\/em><\/div>\n<div class=\"register\">\t\t<div data-elementor-type=\"container\" data-elementor-id=\"14493\" class=\"elementor elementor-14493\" data-elementor-post-type=\"elementor_library\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-2912df93 e-con-full e-flex e-con e-child\" data-id=\"2912df93\" data-element_type=\"container\">\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-2a881fc8 e-con-full guest-only e-flex e-con e-child\" data-id=\"2a881fc8\" data-element_type=\"container\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-9c324b4 elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"9c324b4\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm\" href=\"#login\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">Login<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-110adcd1 elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"110adcd1\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm\" href=\"#register\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">Registrazione<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-69a84aa e-con-full user-only e-flex e-con e-child\" data-id=\"69a84aa\" data-element_type=\"container\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7aaa1461 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"7aaa1461\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<p><em>login avvenuto<\/em><\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-20cd3cae elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"20cd3cae\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm\" href=\"https:\/\/www.convegnonazionaleaiic.it\/wp-login.php?action=logout&#038;redirect_to=\/\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">Logout<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n<div class=\"rating\">[ratingwidget]<\/div>\n<\/div>\n<div class=\"col-md-8 colaiic-8\" style=\"border-left: 1px solid; border-color: #005c97;\">\n<p><a name=\"top\"><\/a><\/p>\n<p><strong><span class=\"titgruppo\">GRUPPO DI LAVORO<\/span><\/strong><\/p>\n<div class=\"gruppo\"><strong>Ing. Duri Claudia<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Ing. Vigan\u00f2 Gian Luca<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Ing. Capuzzo Martina<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Ing. Cicellini Gian Luca<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Ing. Goldoni Davide<\/strong> universit\u00e0 degli studi di brescia<br \/>\n<strong>Ing. Ignoti Lucia Maria<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Dr.ssa Ing Albini Giulia<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Dr. Ing Morandi Luca<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Dr.ssa Ing Scarpellini Martina<\/strong> asst spedali civili di brescia<br \/>\n<strong>Dr. Ing. Pagnoncelli Diego<\/strong> politecnico di milano<\/p><\/div>\n<p><strong><span class=\"titarea\">AREA TEMATICA<\/span><\/strong><\/p>\n<div class=\"area\">Integrazione e interoperabilit\u00e0 tra tecnologie biomediche e sistemi informativi sanitari aziendali<\/div>\n<p><strong><span class=\"titabstractaiic\">ABSTRACT<\/span><\/strong><\/p>\n<div class=\"abstractaiic\">La trasversalit\u00e0 della genetica medica a tutte le branche della medicina fa s\u00ec che molti reparti dell\u2019ASST Spedali Civili di Brescia si avvalgano delle attivit\u00e0 del laboratorio. La provenienza delle richieste inviate alla sezione \u00e8, infatti, per 85-90% interna. La quota rimanente (10-15%) proviene da enti esterni. Inoltre, ancora molti esami vengono inviati ad enti esterni in modalit\u00e0 Service Passivo.  <\/p>\n<p>Con l\u2019obiettivo principale di istituire un punto di raccolta delle richieste di sequenziamento massivo al servizio dei laboratori specialistici presente presso l\u2019ASST degli Spedali Civili di Brescia, \u00e8 stata creata la NGS facility. Tale struttura, garantisce l\u2019efficientamento del processo che, quando disperso sulle differenti realt\u00e0 laboratoristiche, genera spreco di risorse. <\/p>\n<p>Il nuovo modello organizzativo prevede l\u2019accentramento fisico delle strumentazioni dell\u2019ASST in un ambiente unico e con personale dedicato. L\u2019organizzazione della diagnostica basata su tecnologia NGS si pu\u00f2 cos\u00ec riassumere: il materiale biologico da sottoporre ad indagine viene accettato presso i laboratori di competenza (Anatomia Patologica, Laboratorio Ultraspecialistico, Microbiologia, Genetica medica) e in quelle sedi viene estratto il DNA dai campioni. <\/p>\n<p>I campioni di DNA, pseudonimizzati, vengono inseriti nella lista di lavoro dell\u2019NGS facility evidenziando il protocollo da applicare. I vari file prodotti durante le fasi precedenti vengono resi disponibili al laboratorio richiedente che potr\u00e0 effettuare infine l\u2019analisi terziaria. <\/p>\n<p>Al fine di acquisire un sistema unico di gestione dei flussi di lavoro per i laboratori di genetica e piattaforme centralizzate specializzate di sequenziamento NGS con sistema hub-spoke, \u00e8 stato effettuato un lavoro multidisciplinare tra Ingegneria Clinica, SIA e responsabile clinico della NGS facility. L&#8217;Ingegneria clinica ha effettuato il censimento delle apparecchiature coinvolte e dei loro software di concerto con il personale clinico e si \u00e8 poi interfacciata con il SIA per studiare una soluzione che potesse essere compatibile con gli applicativi aziendali. <\/p>\n<p>Il risultato \u00e8 stata l\u2019indizione e aggiudicazione di una gara che permetta l\u2019implementazione di una soluzione compatibile da un lato con le apparecchiature e i verticali in uso, dall\u2019altro con le richieste legate alla cybersecurity e di AGID (es. Il concetto di cloud first) a oggi in vigore.<\/p><\/div>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<div class=\"flip\"><div style=\"display:block\">\n<!-- FlowPaper PDF flipbook plugin v.2.0.6 wordpress.org\/plugins\/flowpaper\/ -->\n<iframe title=\"FlowPaper flipbook pdf viewer\" width=\"100%\" height=\"500\" scrolling=\"no\" class=\"flowpaper-class\" frameborder=\"0\" allowFullScreen=\"true\" lightbox=\"false\" cover id src = \"https:\/\/flowpaper.com\/flipbook\/?pdf=https:\/\/sem2000.s3.eu-west-1.amazonaws.com\/OLC\/0989478442373166690049893\/scent\/130500___5zn3Ubvt.pdf&title=&header=&theme=&singlepage=&thumbs=1&modified=250604225\" seamless=\"seamless\" style=\"margin-bottom:0;display:block;\">Your browser does not seem to support iframes. <a href=\"https:\/\/flowpaper.com\/flipbook\/?pdf=https:\/\/sem2000.s3.eu-west-1.amazonaws.com\/OLC\/0989478442373166690049893\/scent\/130500___5zn3Ubvt.pdf\" target=\"_blank\">Click here to read this PDF<\/a>.<\/iframe>\n<div id=\"flowpaper-logo-bottom\" class=\"flowpaper-logo-bg\" style=\"background:linear-gradient(to right, rgba(0,0,0,0.65) 0%,rgba(0,0,0,0) 200px);width:100%;height:19px; padding-bottom: 1px; padding-left: 5px; padding-right: 10px; display: flex; align-items: center;z-index:9999\"><span style=\"height: 37px; padding-left: 6px;width:90%\"> <a id=\"flowpaper-link\" style=\"fill: #fff\" alt=\"FlowPaper logotype\" title=\"FlowPaper logotype\" href=\"https:\/\/flowpaper.com\" target=\"_blank\"> <img decoding=\"async\" alt=\"Publish PDF flipbooks online\" style=\"height:17px;width:auto;margin-top:11px;\" src=\"https:\/\/www.convegnonazionaleaiic.it\/wp-content\/plugins\/flowpaper-lite-pdf-flipbook\/assets\/flowpaper-logo.png\" border=\"0\"> <\/a> <\/span><span style=\" float: right; right: 0; font-size: 10px; white-space: nowrap; opacity:0.8\"><a href=\"https:\/\/flowpaper.com\/flipbook-maker\/\" target=\"_new\" style=\"text-decoration:none;border-bottom:none;\">Created using FlowPaper Flipbook Maker &#8599;<\/a><\/span><\/div><\/div>\r\n                <script>\r\n                document.addEventListener(\"DOMContentLoaded\", function(){\r\n                    var target_element, iframe_element;\r\n                    iframe_element = document.querySelector(\"iframe.flowpaper-class\");\r\n                    target_element = document.querySelector(\"\");\r\n                    iframe_element.style.height = target_element.offsetHeight + \"px\";\r\n                });\r\n                <\/script>\r\n            <\/div>\n<p><strong><span style=\"color: #003366;\"><a class=\"topaiic\" style=\"color: #003366; text-decoration: underline;\" href=\"#top\">Torna su \u00bb<\/a><\/span><br \/>\n<\/strong><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La trasversalit\u00e0 della genetica medica a tutte le branche della medicina fa s\u00ec che molti reparti dell\u2019ASST Spedali Civili di Brescia si avvalgano delle attivit\u00e0 del laboratorio. La provenienza delle richieste inviate alla sezione \u00e8, infatti, per 85-90% interna. La quota rimanente (10-15%) proviene da enti esterni. Inoltre, ancora molti esami vengono inviati ad enti esterni in modalit\u00e0 Service Passivo.  <\/p>\n<p>Con l\u2019obiettivo principale di istituire un punto di raccolta delle richieste di sequenziamento massivo al servizio dei laboratori specialistici presente presso l\u2019ASST degli Spedali Civili di Brescia, \u00e8 stata creata la NGS facility. Tale struttura, garantisce l\u2019efficientamento del processo che, quando disperso sulle differenti realt\u00e0 laboratoristiche, genera spreco di risorse. <\/p>\n<p>Il nuovo modello organizzativo prevede l\u2019accentramento fisico delle strumentazioni dell\u2019ASST in un ambiente unico e con personale dedicato. L\u2019organizzazione della diagnostica basata su tecnologia NGS si pu\u00f2 cos\u00ec riassumere: il materiale biologico da sottoporre ad indagine viene accettato presso i laboratori di competenza (Anatomia Patologica, Laboratorio Ultraspecialistico, Microbiologia, Genetica medica) e in quelle sedi viene estratto il DNA dai campioni. <\/p>\n<p>I campioni di DNA, pseudonimizzati, vengono inseriti nella lista di lavoro dell\u2019NGS facility evidenziando il protocollo da applicare. I vari file prodotti durante le fasi precedenti vengono resi disponibili al laboratorio richiedente che potr\u00e0 effettuare infine l\u2019analisi terziaria. <\/p>\n<p>Al fine di acquisire un sistema unico di gestione dei flussi di lavoro per i laboratori di genetica e piattaforme centralizzate specializzate di sequenziamento NGS con sistema hub-spoke, \u00e8 stato effettuato un lavoro multidisciplinare tra Ingegneria Clinica, SIA e responsabile clinico della NGS facility. L&#8217;Ingegneria clinica ha effettuato il censimento delle apparecchiature coinvolte e dei loro software di concerto con il personale clinico e si \u00e8 poi interfacciata con il SIA per studiare una soluzione che potesse essere compatibile con gli applicativi aziendali. <\/p>\n<p>Il risultato \u00e8 stata l\u2019indizione e aggiudicazione di una gara che permetta l\u2019implementazione di una soluzione compatibile da un lato con le apparecchiature e i verticali in uso, dall\u2019altro con le richieste legate alla cybersecurity e di AGID (es. 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